保険医登録をマイナポータルで進める実務手順

保険医登録とマイナポータルの基礎知識・実務ガイド

保険医登録とは何か、登録が必要になる場面

保険医登録とは、医師または歯科医師が、健康保険法上の保険診療を行う保険医として登録を受けるための手続きです。薬剤師については、保険薬局において保険調剤に従事するために保険薬剤師としての登録を受けます。医師、歯科医師、薬剤師の免許を取得しただけでは、直ちに保険診療または保険調剤を行えるわけではない点が重要です。
具体的には、医師・歯科医師・薬剤師が免許取得後、初めて保険医療機関または保険薬局で勤務する際に、新規の保険医・保険薬剤師登録が必要です。常勤・非常勤、勤務形態の違いだけで登録要否を判断せず、実際に保険診療または保険調剤に従事する予定があるかを踏まえて確認します。採用手続きの一環として医療機関・薬局が案内することはありますが、マイナポータルによるオンライン申請では、原則として医師・歯科医師・薬剤師本人が手続きする仕組みです。
なお、保険医・保険薬剤師の登録と、保険医療機関・保険薬局としての指定は別の手続きです。前者は個人である医師・歯科医師・薬剤師に関する登録であり、後者は病院、診療所、薬局などの施設に関する指定です。また、勤務開始・退職など施設側で届け出る事項については、保険医等本人の登録申請と異なる書類・届出が必要になることがあります。採用担当者、事務長、薬局開設者は、個人登録と施設の異動届を混同しないように整理しておくことが大切です。
厚生労働省は、保険医・保険薬剤師の新規登録について、マイナポータルを用いたオンライン申請を案内しています。オンライン申請により、申請書を紙で作成して郵送または窓口持参する方法に加え、本人がデジタル上で手続きを進められるようになりました。登録情報をマイナポータル上で確認できることも、勤務先変更や将来の各種変更を管理するうえでの利点です。

参考）保険医・保険薬剤師の登録等に関するオンライン申請について｜厚…
厚生労働省：保険医・保険薬剤師の登録等に関するオンライン申請について

マイナポータルで申請できる手続きと開始時期

保険医・保険薬剤師の新規登録申請は、令和7年2月25日からマイナポータルでオンライン申請が可能となりました。その後、令和8年2月24日からは、転出・転入に伴う管轄地方厚生局長の変更、氏名変更、登録票再交付、登録抹消、健康保険法の所定規定に該当した場合の申請についても、オンライン申請の対象が拡大されています。手続きの対象範囲は広がっていますが、死亡・失そう届はオンライン申請の対象外です。
新規登録と変更申請では、申請先を取り違えやすいため注意が必要です。新規登録の場合、保険医療機関・保険薬局で勤務する予定がある人は、勤務予定先の施設が所在する都道府県を管轄する地方厚生局の事務所等に申請します。一方、現時点で保険医療機関・保険薬局に勤務する予定がない人は、住所地の都道府県を管轄する地方厚生局の事務所等が申請先です。
既に登録済みの保険医・保険薬剤師が変更申請を行う場合は、原則として保険医・保険薬剤師として登録している都道府県の事務所等へ申請します。転居先や新しい勤務先の所在地だけを見て申請先を選ぶのではなく、登録情報に基づく提出先を確認してください。提出先の誤りは不備通知や再申請につながり、登録日や変更の反映時期に影響するおそれがあります。

オンライン化は、申請に関わるすべての提出物が完全に電子化されたことを意味するものではありません。特に、登録票の原本提出が求められる手続きでは、マイナポータルから申請情報を送信した後に郵送対応が残ることがあります。申請ボタンを押した時点で事務処理がすべて完了するとは限らないため、手続きごとの案内と不備通知を最後まで確認しましょう。

東海北陸厚生局：保険医・保険薬剤師の新規登録・諸変更のオンライン申請の開始について

新規登録前に用意するものと申請の進め方

マイナポータルで保険医登録を行うには、本人確認と電子申請のための準備を整えます。基本的には、マイナンバーカード、カード交付時に設定したパスワード、スマートフォン・タブレット・PCのいずれか、そして申請内容に応じた添付書類が必要です。PCまたはタブレットでカードを読み取る場合には、カードリーダライタまたはマイナンバーカード読取に対応したスマートフォンを準備します。
新規登録では、医師免許証、歯科医師免許証、または薬剤師免許証の写しを、PDFまたは画像として添付します。免許証がまだ発行されていない場合には、登録済み証明書の写しを用いることができます。ファイルの画像が不鮮明で氏名、資格、登録番号などを確認できないと、補正の連絡を受ける可能性があるため、撮影時の影、反射、端の欠け、解像度不足を避けることが実務上のポイントです。
申請は、マイナポータルへログインし、「国家資格関連の手続」から該当する保険医・保険薬剤師の手続きに進みます。案内に沿って、本人情報、資格情報、勤務予定先や申請先に関する情報を入力し、免許証等を添付して送信します。入力中に判断が必要な項目がある場合は、所属する医療機関・薬局の担当者へ確認するだけでなく、最終的には提出先である地方厚生局の事務所等へ照会することが確実です。

• マイナンバーカードと、交付時に設定したパスワードを確認する
• スマートフォン、タブレットまたはPCを準備し、PC・タブレットでは読取環境も整える
• 医師・歯科医師・薬剤師免許証、または登録済み証明書をPDF・画像で用意する
• 勤務予定先の所在地と、申請先の地方厚生局事務所等を事前に確認する
• 送信後はマイナポータルの通知を確認し、不備連絡があれば速やかに補正する

スマートフォンに搭載したマイナンバーカードを使う場合にも、端末の生体認証だけでログインできるとは限りません。関東信越厚生局は、スマートフォン搭載のマイナンバーカードによるFace IDやTouch IDではログインできない旨を案内しています。操作直前にログイン方法でつまずかないよう、パスワードの有効性や読取手段を事前に確認し、余裕を持って申請することが有効です。

参考）保険医・保険薬剤師の登録等に関する申請・届出｜関東信越厚生局
関東信越厚生局：保険医・保険薬剤師の登録等に関する申請・届出

登録済み保険医の初期設定と変更申請の注意点

既に保険医・保険薬剤師として登録されている人が、マイナポータルで氏名変更などの変更申請を初めて行う場合は、「初期設定」が必要です。これは、マイナポータルの利用者情報と、地方厚生局が保有する保険医・保険薬剤師の登録情報を紐付けるための手続きです。初期設定は変更申請そのものではないため、初期設定を終えただけでは、氏名や登録内容は変更されません。
初期設定の際には、保険医・保険薬剤師登録票の写しをPDFまたは画像で添付します。登録票を紛失している場合や、手元の登録票と現在の登録情報に差異があると考えられる場合には、自己判断で手続きを進めず、登録先の地方厚生局事務所等に確認してください。初期設定後に改めて該当する変更申請を提出する、という二段階での対応が必要になります。
初期設定には一定の時間を要します。特に人事異動、就職、退職、改姓などが集中しやすい3月から4月は、処理に時間がかかることがあると厚生労働省が案内しています。勤務開始日、保険診療の開始予定、改姓後の資格確認書類との整合などに影響しないよう、変更事由が発生してからではなく、必要書類が揃い次第、早めに初期設定と変更申請の段取りを進めることが望まれます。
一方、マイナポータルで新規登録を行った人、または過去に初期設定を済ませた人は、あらためて初期設定を行う必要はありません。手続きが「新規登録」なのか、「登録済み情報の変更」なのか、「登録票の再交付」なのかを明確にしてからメニューを選ぶことが、重複申請や誤申請の防止につながります。

書面申請・代理申請・原本郵送が必要なケース

マイナポータルが利用できない場合や、医療機関・保険薬局が複数の従事者の手続きを取りまとめる場合には、書面による申請・届出も引き続き利用できます。ただし、書面申請では、申請書・届出書へのマイナンバー記載が原則として必要です。窓口へ持参する場合は番号確認書類と身元確認書類の提示、郵送する場合はそれらの写しの添付が必要になります。
医療機関・保険薬局が本人に代わって代理申請する場合、マイナポータルからの申請はできません。書面での代理申請となり、通常の申請書類・添付書類に加えて、本人による委任状、代理人の身元確認書類などが必要です。新卒採用や法人グループで多数の登録を一括管理する運用では、本人申請と代理申請のどちらを採用するのか、必要書類を誰がいつ回収・保管するのかを明確にしておくと、入職時の不備を抑えられます。
また、オンライン申請を選んだ場合でも、管轄地方厚生局長変更では保険医・保険薬剤師登録票の原本を郵送する必要があります。氏名変更で登録票の書換えを希望する場合には、戸籍抄本と登録票原本の郵送が必要です。登録票がき損した場合の再交付申請、登録抹消、免許取消・停止の処分に関する申請などでも、登録票原本の提出が求められることがあります。紛失時には紛失届を提出しますが、紛失届はオンライン申請に電子ファイルとして添付できる扱いです。
保険医登録は、採用時だけの単発業務ではありません。勤務地が地方厚生局の管轄をまたいで変わる場合、氏名が変わる場合、登録票を紛失・き損した場合、退職等により登録抹消を希望する場合にも、本人と医療機関側の双方で確認が必要になります。マイナポータルを活用すれば、申請時の移動や郵送の負担を減らし、登録内容も確認しやすくなります。ただし、提出先、初期設定、添付書類、原本郵送の有無を手続きごとに確認することが、確実な保険医登録と変更処理の鍵になります。

全国柔道整復学校協会監修教科書 関係法規 2025年版